L'analyse génétique et phylogénétique réalisée sur plusieurs régions de plusieurs CeCoV a révélé que le CeCoV-I et le coronavirus félin de type I (FCoV-I) provenaient d'un ancêtre commun, tandis que le CeCoV-II résultait de plusieurs événements de recombinaison avec une source génétique non identifiée.

Si les CeCoV sont généralement impliqués dans des formes bénignes de diarrhée, il existe certaines souches hypervirulentes de CeCoV-IIa, appelées CeCoV pantropiques, qui sont associées à des gastro-entérites sévères, hémorragiques et parfois mortelles.

Les événements de recombinaison génétique ou de mutation peuvent entraîner la capacité de se propager entre espèces, comme observé chez certains bêtacoronavirus, tels que le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV) en 2003, le coronavirus respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV) en 2014 et coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère, qui pourrait provenir de chauves-souris fer à cheval.

Les carnivores domestiques, c'est-à-dire les chiens et les chats, sont considérés comme les animaux de compagnie les plus populaires dans le monde. Ils partagent leur habitat avec les humains, augmentant ainsi le risque potentiel de transmission d'agents pathogènes zoonotiques. De plus, certains virus qui infectent ces espèces animales sont génétiquement étroitement liés aux virus humains, tels que l'astrovirus félin (FeAstV), la souche 1637F, et le papillomavirus Felis domesticus de type 1 (FdPV-1). Le SRAS-COV-2 s’est propagé dans le monde entier, entraînant une prévalence élevée. Bien que les chiens ne soient pas considérés comme une source d’infection, des études ont montré que les chiens peuvent être infectés par ce virus.

De même, plus récemment, un nouvel alphacoronavirus recombinant canin-félin, CCoV-HuPn-2018, a été isolé chez des patients infantiles atteints de pneumonie. La capacité des CeCoV à évoluer soulève plusieurs questions sur la biologie de ces virus, focalisant des résultats épidémiologiques importants dans le domaine, tant en matière d'évolution virale que de prophylaxie.

La surveillance virale chez les animaux sauvages et domestiques, tels que les chiens et les chats qui sont en contact étroit avec les humains, grâce à l'utilisation combinée de méthodes conventionnelles et moléculaires bien décrites, pourrait être un outil crucial pour surveiller et caractériser rapidement les maladies zoonotiques émergentes et réémergentes. maladies virales, fournissant une base de référence sur la diversité et la circulation des agents pathogènes, utile pour faire face aux futures urgences infectieuses.

Une étude menée par des scientifiques italiens a cherché à déterminer la répartition mondiale des différents types de CeCoV, ainsi que leur apparition en fonction des données démographiques (sexe, race, propriété) et des signes cliniques (diarrhée).

Le CeCoV a été identifié pour la première fois lors d’une épidémie de gastro-entérite chez les chiens en 1971. Depuis lors, plusieurs épidémies de CeCoV ont été signalées dans le monde, démontrant que le CeCoV est un entéropathogène important pour le chien. Des analyses sérologiques et virologiques ont montré que les chiens de tous âges et de toutes races sont sensibles à l'infection et que le virus se propage largement au sein de la population canine, principalement dans les chenils et les refuges pour animaux.

Les critères d'inclusion étaient des études publiées en anglais et dans lesquelles le CeCoV a été identifié et confirmé par des investigations moléculaires.

La prévalence globale du CeCoV était remarquablement variable, avec une prévalence globale de 21,2 % et une large plage de prédiction allant de 17,4 % à 25,6 %, ce qui indique que la prévalence du CeCoV varie considérablement selon les régions et les populations canines. Cependant, ces données indiquent que le CeCoV est une « maladie exceptionnellement répandue ».

La méta-analyse a également montré que les chiens infectés étaient deux fois plus susceptibles d’être asymptomatiques, ce qui « suggère que de nombreux cas d’infection par CeCoV peuvent passer inaperçus ». Cela a des implications pour la gestion et le contrôle de la maladie, puisque des cas non diagnostiqués peuvent « provoquer la persistance et la circulation du virus, ce qui rend difficile le contrôle et la prévention de sa propagation ». Par conséquent, ils indiquent qu’il est crucial « de prendre en compte ces facteurs lors de l’étude et de l’interprétation des différences régionales dans les taux d’infection canine ».

L’étude suggère également que les méthodes de diagnostic traditionnelles, telles que les tests effectués dans les cliniques vétérinaires, « pourraient ne pas suffire à évaluer avec précision la prévalence de la maladie ». Par conséquent, « il est essentiel d’employer des protocoles et des outils de diagnostic fiables pour détecter avec précision les porteurs asymptomatiques ».

Cependant, des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer les modérateurs qui ont un impact significatif sur la prévalence et la distribution des différents sous-types et génotypes de CeCoV. Ainsi, ils ajoutent qu’« il est impératif de mener des essais cliniques randomisés pour acquérir une compréhension plus précise des variables qui influencent la prévalence du CeCoV ».

En effectuant une surveillance continue, les variations régionales de la prévalence du CeCoV chez les chiens peuvent être prises en compte, « améliorant ainsi notre compréhension de la maladie et, à terme, empêchant sa transmission ».

En résumé, « cette recherche met en évidence la nécessité d’une surveillance continue des CeCoV en tenant compte des différences régionales lors de l’évaluation de leur prévalence ». Ces résultats ont des implications pour améliorer la santé des chiens et orienter les stratégies de prévention et de contrôle du CeCoV.